O Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA) sedia diversos programas de pós-graduação da Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), nos níveis especialização, mestrado e doutorado, além da Residência Integrada em Saúde Bucal. 

Especialização: Enfermagem em Nefrologia, Enfermagem em Terapia Intensiva, Enfermagem Obstétrica, Fisioterapia Cardiorrespiratória e Terapia Intensiva, Fisioterapia em Terapia Intensiva Adulto, Fisioterapia Neurofuncional, Medicina do Trabalho, Tratamento da Dor e Medicina Paliativa.

Mestrado e Doutorado: Bioquímica, Cardiologia e Ciências Cardiovasculares, Ciências Médicas, Cirurgia e Ciências Cirúrgicas, Endocrinologia, Enfermagem, Epidemiologia, Gastroenterologia e Hepatologia, Genética e Biologia Molecular, Ginecologia e Obstetrícia, Saúde da Criança e do Adolescente, Pneumologia, Psicologia e Psiquiatria.